CLANNAD relata la historia de Tomoya Okazaki , un estudiante de secundaria de tercer año, al que la suerte, desgraciadamente, no le sonríe. Un día cuando se dirige a su escuela, conoce a Nagisa Furukawa, una estudiante que cursa el tercer año de secundaria, al igual que él. Desde aquí las cosas empiezan a cambiar mucho para él. Empieza una amistad entre los dos, gracias a ello hacen muchos nuevos amigos a los cuales les ayudaran con sus problemas y como alcanzar los sueños de cada uno.